Des produits chimiques ou un choc électrique peuvent créer momentanément des trous dans la membrane plasmidique des cellules végétales et permettre ainsi l'entrée d'ADN. Cette technique nécessite un accès direct à la membrane plasmidique. On commence donc par débarrasser les cellules végétales de leur paroi de cellulose grâce à des traitements enzymatiques. Ces traitements ne laissent qu'une cellule entourée de sa membrane plasmidique : un protoplaste.