Les gènes de virulence (gènes vir, en orange) responsables du processus de transfert sont conservés.

Au niveau de l'ADN-T (en rouge sombre), le fragment d'ADN transféré aux cellules de plantes, on supprime les gènes responsables de la formation de la tumeur et de la pathogénicité;. Les scientifiques les remplacent par le ou les gènes d'intérêt qu'ils veulent transférer.